La Delegación de Formación Teológica coordina y da unidad a todo lo relacionado con la formación dentro de la Diócesis de Alcalá de Henares. En ella se articula la propuesta teológica del Instituto Diocesano de Teología «Santo Tomás de Villanueva», la Extensión Universitaria en Alcalá de Henares del Instituto Superior de Ciencias Religiosas a distancia de la UESD de Madrid y las diversas escuelas diocesanas que programan la formación de sus miembros, especialmente la Escuela de Liturgia, la de Catequistas y la Escuela de Evangelización.
Esta delegación organiza programas de formación, cursos, conferencias y seminarios que cubren temas como la Biblia, la moral cristiana, la historia de la Iglesia y la teología en general. Su propósito no es solo formar intelectualmente, sino también ayudar a las personas a vivir su fe de una manera más consciente y comprometida. Además, esta delegación fomenta el intercambio de ideas y el diálogo sobre cuestiones actuales, ayudando a los fieles a comprender mejor cómo aplicar los principios cristianos a los desafíos del mundo moderno.